SPRISelect 片段筛选试剂盒性能和相关数据

下一代测序 （NGS） 是当今基因组学研究中最普遍的技术。不同的应用有不同的建库需求，需要灵活的解决方案。而 DNA 片段的大小会直接影响测序数据的有效性。SPRISelect 试剂盒旨在让操作人员自由选择需要筛选的片段范围。该试剂采用经过成熟、业界领先的固相可逆固定 （SPRI） 技术，提供稳定的、可重复的和可定制的片段筛选功能。

• 可调 150 到 800 bp 片段筛选范围，便于调整用于特定应用和测序仪的片段
• 高效的磁珠技术消除了对凝胶、芯片或特殊仪器的需求
• 从手动到自动化，可在 96 孔板中进行高通量处理

双侧片段筛选功能

左侧片段筛选可移除小于目标片段的 DNA，而右侧片段筛选将移除大于目标片段的 DNA。通过利用左侧和右侧片段筛选，您可以获得更小范围的 DNA 片段。

使用 SPRISelect 试剂盒对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行双侧筛选。[图 A] 通过一定比例左侧筛选获得主峰为 400bp 的片段。[图B] 通过一定比例右侧选择获得主峰为 200bp 的片段。[图C] 左侧筛选（红色）和右侧筛选（蓝色）的叠加。[图 D] 双侧筛选去除大于和小于目标的片段，并捕获 200bp-400bp 的目标片段范围。对于所有 DNA 片段测量使用 Agilent 2100 生物分析仪高灵敏度芯片（Agilent）。峰 35 和 10300 是内标。

可重复和可调性

SPRISelect 试剂是按照严格的规格要求生产的，可确保每次运行和批次间的可重复性。

使用 SPRISelect 对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行了两种不同的片段筛选。每个片段选择执行三次。三个平行样品都显示出非常一致的片段筛选能力。（左）0.5X 左侧片段筛选（右）0.5X 右侧片段筛选。DNA 片段是使用安捷伦 2100 生物分析仪高灵敏度芯片（安捷伦）测量的。峰 43 和 115 是内标。

（左）0.5X 左侧片段筛选。（右）0.5X 右侧片段筛选。

更少的手动操作时间

使用 SPRISelect 试剂盒和另外两个市售试剂盒对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行片段筛选对比。（左）该图表示单侧片段筛选或纯化时间。单侧筛选的 SPRISelect 工作流分别比供应商 A 和供应商 B 快 4.2 倍和 2 倍。（右）该图表示双侧片段筛选的时间。用于双侧筛选的 SPRISelect 工作流分别比供应商 A 和供应商 B的同类产品快 3.8 和 2 倍。SPRISelect 在所有三个供应商同类产品中所耗处理时间最少，至少为 50%。这个时间基于手动操作 8 个样本的片段筛选所获得。

SPRIselect Left 工作流程

选择比目标更大的 DNA 片段

1. 将 DNA 与磁珠结合
2. 将磁珠与杂质分离
3. 用 85% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
4. 将 DNA 从磁珠上洗脱
5. 转移到存储板

SPRIselect Right 工作流程

Selecting for DNA smaller than a target size or selecting for DNA within a target region.

选择比目标更小的 DNA 片段或在目标领域选择 DNA 

1. DNA 与磁珠结合
2. 将上清液转移到新板
3. 将 DNA 与磁珠结合
4. 将磁珠与杂质分离
5. 用 85% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
6. 将 DNA 从磁珠上洗脱下来
7. 转移到存储板

兼容手动或自动化运行

使用 SPRISelect 对 8、24、48 和 96 个 DNA 样本执行双侧筛选所需的估计手动操作时间和总时间（以分钟为单位）。可以在 Biomek 工作站上手动或自动化执行不同的方法操作。该表表示在 Biomek i7 hybird 工作站上执行的自动化时间。显示手动和自动化之间的时间差异。NR = 不推荐。

用于片段筛选的产品

未用于或验证用于疾病或其他情况的诊断。

贝克曼库尔特，个性化标识，与此处提及的贝克曼库尔特产品及服务标识均属贝克曼库尔特公司在美商标和其他国家注册的商标。所有其他商标归各自所有者财产。