FormaPure XL Performance and Data
从 FFPE 组织中手动或自动提取 RNA、DNA 或总核酸
由于组织制备的特殊性，从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE） 组织中提取核酸具有挑战性。FormaPure XL 试剂盒是专为适用于下一代测序 （NGS） 和其他下游应用（包括 qPCR）的试剂盒。最大程度上保证从 FFPE 样本中获得获得产物的完整性、高产量和纯度，以尽量减少丢失重要遗传信息的风险。
- 专为 FFPE 样本设计，稳定提取用于 下一代测序（NGS）的 RNA 和/或 DNA
- 被证明的体系，可用于 10 µm 至 70 µm样品输入
- 更高的核酸完整性以支持更灵敏的 qPCR 和 NGS 应用 *
下一代测序（NGS）的技术表现始于 RNA 完整性
片段分析表明，FormaPure XL试剂盒提取的 RNA 比柱提法试剂盒从同一块组织中提取的 RNA 获取 DV200 分数百分比更高。更高的 DV200 百分比可产生更好的下一代测序（NGS）的技术表现。
图 1和图 2：FormaPure XL Total 试剂盒和 FormaPure XL RNA 试剂盒提取 RNA 的完整性高于柱提法的试剂盒。利用 Agilent RNA ScreenTape 评估提取的 RNA。采用 FormaPure XL RNA试剂盒（蓝色曲线）和柱提法的备用试剂盒（橙色曲线）从四个不同的 FFPE 样品中提取 RNA。利用 7 个 10μm 组织样本提取乳房和肠道中的 RNA。DV200 值从每个电泳图获得。DV200 值代表的是大于200bp 的 RNA 所占比例。
图 3：根据 Agilent RNA ScreenTape 上所评估的结果显示，FormaPure XL Total 试剂盒和 FormaPure XL RNA 试剂盒提取的 RNA与柱提法的试剂盒和超声裂解试剂盒具有同等甚至更高的完整性。分别从 1 块 10 μm 的乳房、肠道、前列腺和肺组织切片中提取。DV200 值的平均百分比表示为三个重复的实验结果，Error bar 代表三个重复的标准偏差。
核酸产量由以下变量决定：
组织类型；组织大小；肿瘤类型；固定方法；石蜡包埋方法；试剂；储存条件；组织投入量；提取试剂盒；组织块的保存时间。
图 4：使用 FormaPure XL Total 试剂盒和柱提法的试剂盒从 5 种不同 FFPE 组织样本中提取 RNA 和 DNA。所有提取分别使用 7 块 10 μm 切片。上面是三个重复的平均产量。使用 Quant-it 试剂盒（Thermo Fisher ）测定核酸产量。
FormaPure XL 试剂盒允许用户从所需数量的切片中提取核酸。并不是每个实验室都会使用相同数量的组织进行提取。FormaPure XL 试剂盒允许用户根据自定义从或多或少的组织中提取核酸。
| Number of Curls | RNA Yield (ug) | DNA Yield (ug) |
|---|---|---|
| 1 | 1.0 | 1.2 |
| 3 | 3.5 | 3.1 |
| 5 | 10.3 | 11.3 |
| 7 | 13.3 | 9.5 |
表 1：从 FFPE 乳腺组织中提取 RNA 和 DNA。投入使用的切片数量越来越多。核酸产量随着切片数量的增加而增加，但从 7 块 10 μm切片中提取的 DNA 除外（由于切片内组织含量的变化）。
工作流程视图
- FFPE 组织脱蜡
- 裂解 FFPE 组织和解联 RNA
- 转移一半裂解物用于 RNA 工作流程
- 将 RNA 与磁珠结合
- 将磁珠与杂质分离
- 用 80% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
- 使用 DNase I 处理样品
- 用 RBA 将 RNA 重新结合到磁珠中
- 将磁珠与杂质分离
- 用 70% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
- 从磁珠中洗脱 RNA
- 处理 DNA 工作流程中剩余裂解物
- 解联 DNA
- 转移 DNA 工作流程中剩余裂解物
- 使用 RNase A 处理样品
- 将 DNA 与磁珠结合
- 将磁珠与杂质分离
- 用 80% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
- 从磁珠中洗脱 DNA
- 将洗脱的 RNA 和 DNA 转移到新的孔板
自动化耗时 vs. 手动操作耗时
FormaPure XL Total、RNA 和 DNA 试剂盒是一套灵活的核酸提取试剂产品，适用于手动操作或自动化工作流程。
- 基于实验通量进行扩展
- 使用免编方法快速转换
- 提供对试剂、自动化设备和方法专业的技术支持
| FormaPure XL Total | FormaPure XL DNA | FormaPure XL RNA | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Manual | Automated | Manual | Automated | Manual | Automated | |||
| Batch Size | 8 | Hands-on Time | 3.5 | 0.5 | 1 | 0.5 | 2 | 0.5 |
| Total Time | 6.5 | 6 | 3.5 | 5.25 | 4.5 | 5 | ||
| 24 | Hands-on Time | 4 | 0.5 | 1.5 | 0.5 | 2.5 | 0.5 | |
| Total Time | 7 | 6.25 | 4 | 5.5 | 5 | 5 | ||
| 48 | Hands-on Time | NR | 0.5 | NR | 0.5 | NR | 0.5 | |
| Total Time | NR | 6.5 | NR | 5.5 | NR | 5.5 | ||
| 96 | Hands-on Time | NR | 0.5 | NR | 0.5 | NR | 0.5 | |
| Total Time | NR | 6.75 | NR | 5.75 | NR | 5.5 | ||
表 2：预估执行 8、24、48 和 96 孔板 FormaPure XL Total、RNA 或 DNA 核酸提取试剂盒工作所需的动手时间和总时间（以小时计数）。这些方法可以手动或在液体处理系统上自动执行。此表中显示的数据基于 Biomek i7 Hybrid 自动化工作站完成。指出了手动和自动化之间的时间差异。（ NR 指 “不推荐”）
用于从 FFPE 组织进行 RNA、DNA 和总核酸提取的 FormaPure XL 系列试剂盒
FormaPure 系列试剂盒根据您的应用和实验通量需求提供多种试剂盒规格和提取类型。立即填写本页面上的表格，了解报价，联系我们。
| Part Number | Name | Preps |
|---|---|---|
| C35991 | FormaPure XL Total | 50 |
| C35992 | FormaPure XL Total | 96 |
| Part Number | Name | Preps |
| C35996 | FormaPure XL DNA | 50 |
| C35997 | FormaPure XL DNA | 96 |
| Part Number | Name | Preps |
| C36000 | FormaPure XL RNA | 50 |
| C36001 | FormaPure XL RNA | 96 |
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