快速入门 Cytobank 基础知识

有 4 个视频供您开始使用 Cytobank:

  1. 如何开始使用您的数据 (实验管理器、上传/克隆实验、设置比例和补偿)
  2. 如何进入 Cytobank (绘制、裁剪、检查、添加和删除门和种群)
  3. 插图编辑器概述(创建和修改图形、克隆现有图形以进行额外修改、导出插图、使用模板创建新图形)
  4. 叠加图形简介 (使用不同的门控总体或条件创建彩色叠加图,将手动门控总体叠加到 viSNE 图上,导出统计表)

确保可重复性、实现协作并加速发现

通过本页面提供的信息,您将大致了解 Cytobank 平台的功能,并快速开始分析您自己的数据。

流式细胞术和其他单细胞数据的分析需要多个步骤,例如补偿和其他预处理任务、不同绘图类型的门控和数据可视化以及导出统计结果以供进一步分析和绘图。这通常由个别研究人员手动完成,他们甚至可能对每个不同的步骤使用不同的工具。因此,原始数据和最终呈现的结果之间的联系通常不是很明显。

Cytobank 平台专为应对这一挑战而设计。对于在 Cytobank 平台上分析的数据,始终可以从出版质量数据深入到基础原始数据,从而确保保留、安全存储和记录有关如何得出科学结论的重要知识。

Cytobank 平台上的实验管理器提供了一个界面,支持用户通过排序、过滤和标记实验的选项来浏览他们的数据。链接的实验可以在树状层次结构中进行可视化,使研究人员能够快速找到相关实验并轻松掌握分析工作流程的顺序。

国际合作已成为科学创新的动力。 Cytobank 平台使全球的研究人员能够共享他们的数据并在数据分析上进行协作。可以将实验分组到项目中,并且可以为协作者分配自定义访问权限。样本标签提供了重要的上下文信息,每个处理数据集的人都可以访问这些信息,并且不再隐藏在单个实验室笔记本中。其他信息(如实验方案或其他方法的结果)可以附加到 Cytobank 平台上的实验中,以创建中央信息库。

在本视频中,您可以了解如何开始上传数据、设置比例、补偿数据以及利用实验管理器浏览实验的不同部分或共享数据。

 

该视频概述了如何在 Cytobank 平台中对人群进行和处理。

 

复杂数据集的动态图形生成

在从复杂实验中创建数字时,Cytobank 平台提供的主要区别之一是使用样本标签生成结果的动态可视化。 示例标签成为插图编辑器中的变量。 这些变量可以打开或关闭并动态重新排列以构建和修改图形。 这允许人们在 FCS 文件名级别之上工作,而是使用实验中存在的科学变量来构建图形,同时保留对底层实验注释和数据处理步骤的透明访问。

在本视频中,您将大致了解插图编辑器。 您可以学习如何创建和修改图形、克隆现有图形以进行额外修改和导出插图。

 

在下一个视频中了解叠加图形的介绍。 了解如何使用不同的门控种群或条件创建彩色叠加图,并将手动门控种群叠加到 viSNE 图上。

 

In this overview video you learn how to virtually concatenate events from multiple files into one single dot plot without the need to move data to other software.

 

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