单细胞基因组学与单细胞分析
源自单细胞的小量测序文库
Echo移液器可针对源自单细胞的基因物质的全基因组和转录组分析实现库制备的小型化。借助精准的无接触转移,Echo系统可将多重置换扩增(MDA)反应液的量减少75%或更多。用于RNA或DNA下一代测序(NGS)的库可减少至10 µL或更少。
减少多重置换扩增(MDA)反应体积
对于了解在有机物整个生命期间发生的基因和表观遗传变异来说,单细胞基因组学(SCG)是至关重要的。当前,癌症研究项目依靠SCG来研究人口和罕见细胞活动内的单独细胞类型,从而克服由异质性肿瘤样品带来的数据挑战。
A采用MDA的单细胞DNA扩增原本就容易遭到污染。在将样品或试剂转移到PCR反应液的过程中,来自所用枪头或喷嘴中的外源性DNA无法在紫外光照射步骤中被消解。Echo移液器的非接触声波转移能力能够彻底避免接触到任何DNA,从而显著减小污染风险。此外,低纳升级的转移精准度也可降低持续的试剂成本。
通过将Echo移液器的小量声波转移能力与针对RNA或DNA测序的库制备套件相结合,研究人员能够显著增加每个套件所生成的库数量。通过将转移量减少75%或更多,及在无需反复稀释的情况下池化测序库,Echo系统能够小型化单细胞库制备并提升制备质量。
主要优势
- 通过有效的实验小型化来降低操作成本
- 改善数据质量且实验体积低至250 nL
- 避免交叉污染
- 为基因组实验定制一体化的系统和软件