优化 NGS 工作流程的成本控制策略

二代测序（NGS）作为基因组学研究的核心技术，助力实现了众多前所未有的新发现。相较于传统方法，高通量基因组测序能够快速提供全面的基因组信息，且通常成本更低。然而，尽管优势显著，在 NGS工作流程的各阶段也可能会产生意料之外的巨大成本，使实验室面临预算压力。

本文中，贝克曼库尔特生命科学现场应用总监 Arto Klug 讨论了纯化方法、自动化平台、试剂和供应商的正确组合如何实现更快、更具成本效益的 NGS 工作流程，以满足每个实验室的特定需求。

NGS 文库纯化的隐性成本

NGS 的 RNA 和 DNA 纯化过程中，需要有效去除酶、接头和引物二聚体等杂质，避免引发背景噪声，干扰测序流程。准确可靠的结果取决于精确和有效的样品制备。特别是在低样品起始量的情况下，实现文库高效纯化的同时，最大程度减少遗传学样品损耗尤为重要。

若未能有效去除这些污染物，将会导致数据质量不佳，甚至可能需要重复进行实验（如果有额外的样品材料可供使用），这势必会延长 NGS 工作流程的整体耗时，并增加额外成本。另外，因样品污染而需要进行多次重复实验时，市售的 NGS 核酸纯化试剂盒可能会大幅消耗实验室的预算配额。

固相可逆固定（SPRI）技术 是一种先进的核酸提取技术，利用顺磁珠按类型和大小，选择性、可逆性与核酸结合。该技术适用于核酸样品的高性能分离、纯化、磁珠纯化和特定大小片段筛选。SPRI 磁珠大小均匀，可实现高度可重复的结果，具备高结合能力、低非特异性结合率，并能够实现快速纯化，支持更高效的工作流程和更高的实验通量。

贝克曼库尔特精心开发了一系列基于 SPRI 技术的 基因组试剂方案，能够高效地从各类典型以及更具挑战性的样品中高效提取 DNA 与 RNA。此外，依托 SPRI 磁珠的纯化技术，无需离心或过滤等预处理步骤，即可在液体处理工作站上轻松实现自动化操作，进而大幅提升性能，赋予工作流程更高的灵活性与扩展潜力。

自动化 NGS 文库制备

构建 NGS文库往往繁琐且耗时，通常需数日才能完成，势必影响实验室的通量及整体生产力。此外，对每个样品与试剂进行手动移液操作时，可能会因操作差异导致移液量不一致，进而对最终结果产生负面影响，甚至引发成本高昂的重复实验。

NGS 文库制备的自动化，能够助力实验室显著提升实验通量，大幅削减手动操作时间，并有效规避手动操作带来的误差，从而确保数据更加一致可靠。此外，自动化的样品制备流程还能有效减少重复实验的次数，避免成本高昂的试剂消耗，是实现成本节约策略的关键一环。

遗憾的是，与手动文库制备相比，市面上许多自动化平台运行时需要耗费大量昂贵的死体积试剂。此外，由于无论总实验批次规模如何，自动化过程通常需要相同的死体积，因此，处理一块板部分孔的每个样品成本通常比处理整板更高。

贝克曼库尔特功能强大的自动化液体处理平台，已对 NGS文库制备的每一步骤实施了标准化作业，有助于消除手动操作带来的误差，确保结果更加一致可靠。该平台广泛适用于各类样品类型、体积及批次规模，同时，通过微量化反应体系，大幅降低文库制备成本。此外，还可增加免手动操作时间，显著提升实验室工作效率。

Biomek NGeniuS二代文库制备系统每次运行可灵活处理 4-24 间任意数量的样品，全面整合热循环仪、实验耗材搬运及试剂自动分装功能，延长实验室人员的无人值守时间并消除人为错误。内容丰富的 NGS 样品制备方案应用库，简化了文库制备流程，并搭载直观的试剂识别系统，可在试剂使用前自动检查是否出错，防止加载错误，确保无后顾之忧。

我们还提供Echo声波移液系统，通过纳升和亚微升级非接触式液体转移实现反应体系的微量化，大幅减少试剂消耗并削减相关成本，特别是对于低样本量、高通量的实验。Echo 声波移液系统非接触式任意孔间精准的移液性能，有助于快速实现等摩尔 Pooling 和归一化，所有这些功能均可通过一个简便直观的软件界面实现。

我们资深的应用科学家能够精准计算出实验所需的死体积，从而为客户提供确切的成本估算。同时，我们的基因组试剂盒产品系列配备了富余的试剂材料，充分考量到自动化操作中可能产生的额外死体积。这些试剂盒无论是用于手动还是自动化工作流程，都能帮助客户最大限度地减少试剂浪费，有效规避额外的隐性成本。

自定义 NGS 工作流程

根据各实验室的现有基础设施与特定需求，量身定制纯化方法、平台及试剂组合，对于削减 NGS 中意外及不必要的成本至关重要。与可靠且专业服务的供应商携手合作，这个供应商能够理解如何定制工作流程以适应现有的实验室实践，也是为 DNA 与 RNA 测序制定稳健且面向未来的成本优化策略的关键一环。

我们与多样化的客户群体携手合作，从特定设备、专业软件到实验室配置，精准把握其独特需求，旨在帮助客户优化实验结果的同时，避免一切不必要的成本支出。期待与您联系，共同探讨我们如何助力您打造更高效、更经济的 NGS 工作流程。