AMPure XP核酸纯化试剂盒

应用领域: PCR产物和DNA纯化、NGS文库纯化

作为 “金标准”试剂盒，AMPure XP 磁珠被广泛应用于NGS行业，超 200 款文库构建试剂盒推荐使用 AMPure XP，其中包括业内主流测序公司的试剂盒产品。

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概述

AMPure XP 核酸纯化试剂盒适用于不同基因组应用中的 DNA 纯化步骤，如二代测序（NGS）、qPCR/ddPCR/PCR、基因芯片及其他酶反应。基于 SPRI 技术 （固相载体可逆固定化）的AMPure XP，采用超顺磁性磁珠按类型和大小选择性地与核酸结合。

结合DNA片段

高回收率，高效回收大于100 bp的扩增片段

有效去除多余的 dNTP、引物、引物二聚体、盐离子和其他杂质

尺寸选择一致可预测

AMPure XP 试剂可最大限度地提高回收率、重复性和回收速度，从而加速整个 NGS 工作流进程，满足当今严苛的基因组应用需求，最大限度避免遗漏重要的遗传信息。鉴于此，超 200 款文库构建试剂盒推荐使用 AMPure XP作为唯一的纯化选项，包括来自业内主流测序公司（如Illumina，Oxford Nanopore Technologies、PacBio和Thermo Scientific）的试剂盒。

规格参数

起始核酸	PCR产物、片段化DNA
起始核酸	DNA
回收	AMPure XP试剂主要结合并纯化> 100 bp的PCR产物。标准回收率在60-90%之间，通常在70-90%之间。
磁珠ratio值	1.8 倍用于纯化。了解更多信息关于磁珠尺寸的选择以及为何磁珠ratio值至关重要。
规格	液体
体积	5 毫升、60 毫升或 450 毫升
应用领域	PCR和DNA产物纯化、NGS文库纯化
处理模式	自动或手动
技术	基于SPRI的超顺磁性磁珠技术
存储温度	4 °C

数据和性能

下图展示了使用 AMPure XP 试剂纯化剪切 gDNA 并采用Agilent TapeStation system分析结果，数据表明：参比值与 1.8X ratio值之间的相对差异印证了AMPure XP 试剂在保持高效回收率的同时，确保可预测的高性能。

Agilent TapeStation traces of sheared gDNA purified using the AMPure XP beads from Beckman Coulter Life Sciences

CHART COLOR	Bead/Sample Ratio
PINK	Input/Reference
RED	1.8X
BLUE	0.9X
GREEN	0.7X
AQUA	0.6X

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避免丢失关键数据

当您在研究中投入了大量资金时，AMPure XP 试剂是您纯化和提取步骤的不二之选。在这一关键步骤中，产量损失会导致关键数据丢失，从而可能错失最重要的研究发现。与其他核酸纯化试剂相比，AMPure XP试剂可帮助用户多保留多达 34% 的遗传信息。

Investing in AMPure XP Beads for Cleanup and Size Selection Retains Up to 34% of Genetic Information

该信息图显示了核酸提取、文库构建、文库富集、纯化和测序等NGS应用步骤所对应的成本。该成本基于2017年市售试剂盒及其平均标价进行计算。完成已知量DNA纯化步骤后，采用Picogreen Assay测定DNA总产量以计算纯化效率。然后使用相对于AMPure XP试剂性能的得率，来计算效率对各种市售文库构建方法和纯化试剂更改的影响。

工作流与方案

AMPure XP 工作流程

将磁珠与DNA结合
将结合有核酸的磁珠与杂质分离
用 70% 乙醇洗涤磁珠以去除杂质
从磁珠上洗脱DNA
转移至新板

AMPure XP核酸纯化试剂盒既可采用手动操作也可搭配自动化工作站实现自动化操作，具体取决于批次运行数目或实验整体通量。

在右表中，您可查看分别运行48个、96个和 4 x 96个样品 AMPure XP 纯化所预估的手工时间和自动化时间（以分钟计）。

了解有关 Biomek i5 96通道基因组学工作站中 AMPure XP PCR 纯化系统自动化操作的更多信息，请阅读《应用指南》。

点击阅读《应用指南》

			手动工作流	自动化工作流
批次运行数目	48	手动操作时间	25	5
	48	总时间	25	22
	96	手动操作时间	30	5
	96	总时间	30	22
	4 x 96	手动操作时间	NR	10
	4 x 96	总时间	NR	46

NR = 不推荐

资源

彩页

数据表

应用指南

客户反馈

应用指南

彩页

视频

常见问题

该试剂可结合DNA和RNA片段；但 RNAClean XP 试剂试剂是在无RNase的条件下生产，且经QC测试是不含RNase的，而AMPure XP试剂则不同。

AMPure XP试剂均基于产品说明书上标注的储存温度进行制造和测试，我们仅能确保该温度下的试剂性能。

点击此处查阅贝克曼库尔特生命科学 AMPure XP 技术文档。

尽管其他机构组织确实开发了片段大小筛选方案，但我们无法确保试剂性能能否支持此类应用。我们推荐您使用专为片段大小筛选而开发的 SPRIselect 试剂，点击访问此页面。

不会。任何转移到最终目标板的磁珠在下游酶促反应中均表现为惰性。

可以，但回收率会随洗脱体积的减少而降低。此外，如果在分离过程中磁珠无法吸附磁力架，为避免磁珠残留，则可能需留下少量洗脱液。因此，请确保将磁珠完全重悬于洗脱缓冲液中。

磁珠的结合能力非常强，适用于任何样品类型。可将至少 7 μg 的核酸与 1 μL AMPure XP 试剂结合，但样品会变得过于粘稠，影响后续样品移液步骤。

回收率取决于片段大小、样品体积、样品浓度、洗脱体积等因素。在理想条件下，回收率高达90%，但在次优条件下，回收率也可低至60%。

AMPure XP试剂采用的超顺磁珠依靠多因素平衡化学技术完成核酸结合、洗涤和洗脱步骤。结合缓冲液组分步骤有助于核酸固定在磁珠表面富含官能团的结合位点，洗涤步骤在溶解并去除污染物的同时，保持微妙平衡。洗脱步骤则会破坏这种平衡并重新溶解核酸，使其与磁珠分离。

在完成最后一次乙醇洗涤步骤后，加入洗脱缓冲液前，可进行干燥步骤。对于非常大的片段（如gDNA）的纯化，不建议进行干燥步骤，因为回收率会因此降低。已知长达 40 kb 的片段可容许干燥步骤。

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引用文献

AMPure XP reagents have been cited in over 52,000 publications on Google Scholar and referenced in articles in Science, Nature, and PNAS. Here are two featured articles:

Cleanup barcoded PCR reactions during library preparation
Greenwald WW et al. Subtle changes in chromatin loop contact propensity are associated with differential gene regulation and expression. Nat Commun. 2019 Mar 5;10(1):1054. doi: 10.1038/s41467-019-08940-5.

Cleanup cDNA
Peffers MJ et al. Transcriptomic profiling of cartilage ageing. Genom Data. 2014 Mar 19;2:27-8. doi: 10.1016/j.gdata.2014.03.001.